Здравствуйте.
Цитата: Я как Индивидуальный Предприниматель заключил договор аренды муниципального недвижимого имущества с "Комитетом по управлению имуществом Администрации городского округа Домодедово Московской области". Стоимость арендной платы в договоре указана "без учета ндс". Являюсь ли я по данному договору налоговым агентом по ндс?
Верно, являетесь.
НК РФ Статья 161. Особенности определения налоговой базы налоговыми агентами
3. При предоставлении на территории Российской Федерации органами государственной власти и управления, органами местного самоуправления в аренду федерального имущества, имущества субъектов Российской Федерации и муниципального имущества
налоговая база определяется как сумма арендной платы с учетом налога. При этом налоговая база определяется налоговым агентом отдельно по каждому арендованному объекту имущества. В этом случае налоговыми агентами признаются арендаторы указанного имущества, за исключением физических лиц, не являющихся индивидуальными предпринимателями. Указанные лица обязаны исчислить, удержать из доходов, уплачиваемых арендодателю, и уплатить в бюджет соответствующую сумму налога.
Цитата: Если да, НДС нужно считать с верх стоимости аренды?
В договоре сумма аренды в том числе НДС указана?
Если так, то Сумма НДС агента=Стоимость аренды в т.ч. НДС*18/118
Цитата: Нужно ндс перечислять в налоговую и сдавать декларацию по ндс?
Да, п. 5 ст. 174 НК РФ
5. Налогоплательщики (в том числе являющиеся налоговыми агентами), а также лица, указанные в пункте 8 статьи 161 и пункте 5 статьи 173 настоящего Кодекса, обязаны представить в налоговые органы по месту своего учета соответствующую налоговую декларацию по установленному формату в электронной форме по телекоммуникационным каналам связи через оператора электронного документооборота в срок не позднее 25-го числа месяца, следующего за истекшим налоговым периодом, если иное не предусмотрено настоящей главой.
Налоговые агенты, не являющиеся налогоплательщиками или являющиеся налогоплательщиками, освобожденными от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога, обязаны представить в налоговые органы по месту своего учета соответствующую налоговую декларацию в срок не позднее 25-го числа месяца, следующего за истекшим налоговым периодом.
Налоговые агенты на спец режимах вправе сдавать декларацию по НДС агента на бумажном носителе.
Разъяснено, в каком случае налоговые агенты по НДС, применяющие «упрощенку», могут сдавать декларации по НДС на бумагеПосмотрите тему
НДС при аренде муниципального имущества